RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PATE4P0C8F1 98 aa28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLO1Q04760 184 aa28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2T4Q8NH00 348 aa28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGFBP3Q8TAT2 258 aa28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 EME1Q96AY2 570 aa28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXN4Q96NZ1 517 aa28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ROS1P08922 2347 aa28.83■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPR1 153 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCD4O14678 606 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SURF4O15260 269 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB36O95755 333 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANPEPP15144 967 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPRL3Q12980 569 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF75AQ96N20 296 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABARAPL3Q9BY60 117 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL3Q9UKT7 428 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 CST2P09228 141 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A1P53007 311 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM53Q6P2H8 277 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RADILQ96JH8 1075 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF121Q9H920 327 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ORC6Q9Y5N6 252 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TACC2O95359 2948 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCG5P05408 212 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 CECR9P0C854 216 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHA2P29317 976 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPAP49450 140 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO17Q96EF6 278 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 WACQ9BTA9 647 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRRG3Q9BZD7 231 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZAR1LA6NP61 321 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAAP10253 952 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAICSP22234 425 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAD23AP54725 363 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP10-9P60411 292 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSM6P62312 80 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHA8Q96JA3 519 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF416Q9BWM5 594 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMC7Q9NPA0 242 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf71A8MTZ7 269 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 CELA3BP08861 270 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCBD1P61457 104 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSF2Q03933 536 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNMB1Q16558 191 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM5Q6NVV9 412 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYT9Q86SS6 491 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROKR2Q8NFJ6 384 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIBC2Q9H4K1 309 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCLRE1BQ9H816 532 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPZL1O95297 269 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLAUP00749 431 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLX4IPQ5VYV7 408 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 UGT2A3Q6UWM9 527 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC26A10Q8NG04 563 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf40Q8WZ69 217 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TVP23BQ9NYZ1 205 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM183AA6NL82 134 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM171A2A8MVW0 826 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPANK1O95872 356 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINA5P05154 406 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF32P17041 273 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPI1P17947 270 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAAAQ02083 359 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPOCK1Q08629 439 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNAPC1Q16533 368 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A25Q6T423 547 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEPDC4Q8N2C3 294 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL17RDQ8NFM7 739 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC29A1Q99808 456 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNS3Q9BQ31 491 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPG11Q96JI7 2443 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAP6Q13023 2319 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYAAP02489 173 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYCR1P32322 319 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB39AQ14964 217 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF584Q8IVC4 421 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 KBTBD8Q8NFY9 601 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTP4A1Q93096 173 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 MS4A3Q96HJ5 214 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLCE1Q9P212 2302 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHISA9B4DS77 424 aa28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms