RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SFXN2	Q96NB2	322 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD6	Q9BV23	337 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	UPB1	Q9UBR1	384 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	NUP50	Q9UKX7	468 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MPPED2	Q15777	294 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR6S1	Q8NH40	331 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR1L3	Q8NH93	324 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ASB5	Q8WWX0	329 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM234	Q8WY98	164 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		A6NIZ1	184 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PNP	P00491	289 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CXCL2	P19875	107 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	RAP1B	P61224	184 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	RAP1A	P62834	184 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	VWA2	Q5GFL6	755 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB119	Q8N690	84 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR52N5	Q8NH56	324 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	GPX8	Q8TED1	209 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OPN4	Q9UHM6	478 aa		16.56	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0A6YYH2	397 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		A6NJ64	397 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	WNT11	O96014	354 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MELTF	P08582	738 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CD37	P11049	281 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	HTR2C	P28335	458 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CAPZA1	P52907	286 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A5	P58743	744 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R19	P59542	299 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CDH26	Q8IXH8	852 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	D2HGDH	Q8N465	521 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	HHLA2	Q9UM44	414 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	LRP12	Q9Y561	859 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GX78	115 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		B8ZZF3	427 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	LPL	P06858	475 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO45	P0C2W1	286 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	GMFB	P60983	142 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CSRP2	Q16527	193 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC107	Q8WV48	283 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A28	Q96A46	364 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	APMAP	Q9HDC9	416 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		R4GMQ9	66 aa		16.55	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPC1	479 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf51	A8MQB3	221 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MEN1	O00255	615 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DUX1	O43812	170 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	KDM4B	O94953	1096 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF823	P16415	610 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	EFNA3	P52797	238 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR1D5	P58170	312 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	AANAT	Q16613	207 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		16.54	■□□□□ 0.24

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