RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557758.1

PRMT5-227, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-227	ENST00000557758	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NQO2	P16083	231 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PMCH	P20382	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	UGT1A4	P22310	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	UGT1A3	P35503	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DDOST	P39656	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	KCNJ3	P48549	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CSRP3	P50461	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MFAP2	P55001	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IL18R1	Q13478	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR5I1	Q13606	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GPNMB	Q14956	572 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PTPRD	P23468	1912 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GOSR2	O14653	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ETHE1	O95571	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TIMP1	P01033	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	HLA-H	P01893	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IL32	P24001	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IL12B	P29460	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SDC4	P31431	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OPRL1	P41146	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NR4A2	P43354	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DSCR9	P59020	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DYNLT1	P63172	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DEFB103A	P81534	67 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	VLDLR	P98155	873 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	STX3	Q13277	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ART3	Q13508	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GNMT	Q14749	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CASP8	Q14790	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	VAMP3	Q15836	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CARM1	Q86X55	608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms