RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 ANGPT2O15123 496 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SNX3O60493 162 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ENTPD5O75356 428 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 KRT75O95678 551 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 PLATP00750 562 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 PTHP01270 115 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 IGHV3-13P01766 116 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ETFAP13804 333 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CDKN2CP42773 168 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CRATP43155 626 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SLC6A9P48067 706 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CRISP3P54108 245 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 NCALDP61601 193 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 BTG1P62324 171 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 PUDPQ08623 228 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 KLF10Q13118 480 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 MELKQ14680 651 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SLC36A2Q495M3 483 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 GPR157Q5UAW9 335 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 RNF220Q5VTB9 566 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF627Q7L945 461 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 LRRC18Q8N456 261 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SCAIQ8N9R8 606 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 HIPK4Q8NE63 616 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TSPEARQ8WU66 669 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 GTF2H4Q92759 462 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 MSL2Q9HCI7 577 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CALML5Q9NZT1 146 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SELENONQ9NZV5 590 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 RYR3Q15413 4870 aa6.77□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 A0A1B0GWA3 101 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM247A6NEH6 219 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 A8MXK9 166 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 LRRN3E7EW58 273 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 KRT34O76011 436 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 MFN2O95140 757 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF205O95201 554 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 OR6A2O95222 327 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 SNAP29O95721 258 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 FAM107AO95990 144 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 MELTFP08582 738 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ADORA3P0DMS8 318 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 THRBP10828 461 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 BMP2P12643 396 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TNFSF4P23510 183 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 MMP15P51511 669 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 DSTNP60981 165 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 PAX8Q06710 450 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ZMYND11Q15326 602 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 MAPRE2Q15555 327 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 LINC01006Q8NI28 216 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ABHD4Q8TB40 342 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 UPRTQ96BW1 309 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM19Q96HH6 336 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 EPYCQ99645 322 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ARHGDIGQ99819 225 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 GLTPQ9NZD2 209 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 PLXNB1O43157 2135 aa6.76□□□□□ -1.33
PCNX1-215ENST00000557428 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms