RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	GNGT2	O14610	69 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CLOCK	O15516	846 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CHP2	O43745	196 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PDE5A	O76074	875 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	VAMP5	O95183	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	BGLAP	P02818	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GGT1	P19440	569 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CALB2	P22676	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	EDNRA	P25101	427 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR3A2	P47893	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CENPA	P49450	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ERF	P50548	548 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	BID	P55957	195 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	EGR4	Q05215	589 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	LTB	Q06643	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAM2	Q15035	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PYURF	Q96I23	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	LIME1	Q9H400	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RERGL	Q9H628	205 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MED29	Q9NX70	200 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PRG6	482 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PLPP3	O14495	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DNPH1	O43598	174 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FMO6P	O60774	539 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	UPK3A	O75631	287 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CTAG2	O75638	210 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SEC14L2	O76054	403 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR7A10	O76100	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR5F1	O95221	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GADD45G	O95257	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	BCL10	O95999	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	HPR	P00739	348 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PLAU	P00749	431 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MT-ND1	P03886	318 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CD79A	P11912	226 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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