RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 GADD45GO95257 159 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 FABP3P05413 133 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 FAM157BP0CG42 384 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 DAOP14920 347 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 RAD52P43351 418 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 SPIBQ01892 262 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 MESTQ5EB52 335 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 LRP11Q86VZ4 500 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 FITM2Q8N6M3 262 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 TPK1Q9H3S4 243 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 FZR1Q9UM11 496 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 NF1P21359 2839 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 A0A1W2PPL8 197 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 PRSS37A4D1T9 235 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 UNC119BA6NIH7 251 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 H7C1C5 153 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 FAM107AO95990 144 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 LCKP06239 509 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF250P15622 560 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 MSR1P21757 451 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 STOMP27105 288 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 LAP3P28838 519 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 SDHAP31040 664 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 ALDH3B1P43353 468 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 UCP2P55851 309 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 SELENOVP59797 346 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 PCBD1P61457 104 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 LCN6P62502 163 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 PSG4Q00888 419 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 GGTLC2Q14390 218 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 SYT9Q86SS6 491 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF786Q8N393 782 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 NSL1Q96IY1 281 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 WACQ9BTA9 647 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 POLE4Q9NR33 117 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 DUSP13Q9UII6 198 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD8-204ENST00000544999 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 A0A1W2PPW3 197 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 B2RBV5 119 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 GIFP27352 417 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 FXYD6P3P58550 94 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 RASD2Q96D21 266 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 GPA33Q99795 319 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 OR51B6Q9H340 312 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 GPR160Q9UJ42 338 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 TXNDC12O95881 172 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 CCNOP22674 350 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 RRM2P31350 389 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 GZMKP49863 264 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 RPS6KA3P51812 740 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 ERVS71-1P61550 626 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 MTX3Q5HYI7 312 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 ADCK1Q86TW2 530 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD8-204ENST00000544999 MUC13Q9H3R2 512 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms