RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC25BP30305 580 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35A2P78381 396 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf88Q6PI97 169 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP6Q96JE9 813 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5M11Q96RB7 305 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHID1Q9BWS9 393 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIRPDQ9H106 197 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL19Q9UHD0 177 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM233B4DJY2 109 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRN3E7EW58 273 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BUX3 64 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SURF4O15260 269 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ENTPD5O75356 428 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHEK2O96017 543 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F13BP05160 661 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRM2P08172 466 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 QDPRP09417 244 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC159P0C7I6 412 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NR2F1P10589 423 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPT2P23786 658 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAFAH1B1P43034 410 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DLX1P56177 255 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAV1Q03135 178 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAF11Q15544 211 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL23RQ5VWK5 629 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5AS1Q8N127 324 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf82Q8WW14 230 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC38A4Q969I6 547 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM54Q969K7 222 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf30Q96M34 536 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASPNQ9BXN1 380 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POFUT1Q9H488 388 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 G3V2L1 256 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BQF6 201 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PF4P02776 101 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIPFP07098 398 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTMSP20962 102 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRPS1L1P21108 318 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PUDPQ08623 228 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MELKQ14680 651 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIN52Q52LA3 116 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD276Q5ZPR3 534 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNKDQ8N490 385 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5R1Q8NH85 324 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGR3Q8TD06 166 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF566Q969W8 418 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEB18Q96M61 343 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEIOCA2RUB1 952 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC30A6NM36 301 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10H3O60404 316 aa8.34□□□□□ -1.07
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