RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522336.5

CPEB4-209, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CPEB4, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-209ENST00000522336 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 SIAH3Q8IW03 269 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 OR6N1Q8NGY5 312 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 NDNFQ8TB73 568 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 THEM6Q8WUY1 208 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 NSMAFQ92636 917 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 SMIM19Q96E16 107 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 DACH2Q96NX9 599 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 OR8B4Q96RC9 309 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 CENPOQ9BU64 300 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 EXO5Q9H790 373 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 BCO1Q9HAY6 547 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 GP6Q9HCN6 339 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 EMC3Q9P0I2 261 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 GNG8Q9UK08 70 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF175Q9Y473 711 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 APC2O95996 2303 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 E9PI62 339 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 DHHO43323 396 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 GPRIN2O60269 458 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF254O75437 659 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 UPK3AO75631 287 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 SC5DO75845 299 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 MPZL1O95297 269 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 PDGFAP04085 211 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 SPARCP09486 303 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 PSKH1P11801 424 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 TMPRSS3P57727 454 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 TBR1Q16650 682 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 MEP1BQ16820 701 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 DGUOKQ16854 277 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 LIPNQ5VXI9 398 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 FDX2Q6P4F2 183 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 AAED1Q7RTV5 226 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 OR52N5Q8NH56 324 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ST7LQ8TDW4 575 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ABHD3Q8WU67 409 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 SARAFQ96BY9 339 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ABHD6Q9BV23 337 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 MROQ9BYG7 248 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 NELFAQ9H3P2 528 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 POLE4Q9NR33 117 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.5□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 A0A1W2PPL8 197 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 GABRPO00591 440 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 SERPINA3P01011 423 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 FCGR2AP12318 317 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 EDNRAP25101 427 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 DCTDP32321 178 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 NTF4P34130 210 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF84P51523 738 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 CCR9P51686 369 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 FABP5Q01469 135 aa7.49□□□□□ -1.21
CPEB4-209ENST00000522336 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms