RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RASL12Q9NYN1 266 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OPTCQ9UBM4 332 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PITPNC1Q9UKF7 332 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIAL4EA0A075B759 164 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS38A1L453 326 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIAL4DF5H284 164 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR31O00270 319 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GOSR2O14653 212 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3BGRLO75368 114 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AGFG2O95081 481 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GABARAPO95166 117 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR8U9P0C7N5 309 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIAL4FP0DN26 164 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 EPXP11678 715 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FDXRP22570 491 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CERS1P27544 350 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TAS2R41P59536 307 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 DPYSL3Q14195 570 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TBR1Q16650 682 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CCSMST1Q4G0I0 132 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FHL5Q5TD97 284 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR59Q6PJI9 974 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AHSA2Q719I0 299 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4S2Q8NH73 311 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 THAP4Q8WY91 577 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PIGTQ969N2 578 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 COQ10AQ96MF6 247 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 WDFY2Q96P53 400 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRDL1Q9BU40 450 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TAAR2Q9P1P5 351 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 COMMD3Q9UBI1 195 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RFNGQ9Y644 331 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KNL1Q8NG31 2342 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PR48 441 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 M0R036 132 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MYL12BO14950 172 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GNG7O60262 68 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PDYNP01213 254 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BCHEP06276 602 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SELEP16581 610 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MYL12AP19105 171 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MAKP20794 623 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL6P41182 706 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXL2P58012 376 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC42P60953 191 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CKS1BP61024 79 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 IL11RAQ14626 422 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AGERQ15109 404 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PEA15Q15121 130 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP51A1Q16850 503 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52W1Q6IF63 320 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NRGNQ92686 78 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RORBQ92753 470 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ART4Q93070 314 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SFRP2Q96HF1 295 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM19Q96HH6 336 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TBX5Q99593 518 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1A2Q9Y585 309 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PKD1L2Q7Z442 2459 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 EML5Q05BV3 1969 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms