RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 ADRA2CP18825 462 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 AVPR2P30518 371 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 P2RY4P51582 365 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CCR9P51686 369 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CAMK2DQ13557 499 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TRIM63Q969Q1 353 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TAAR9Q96RI9 348 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZPBPQ9BS86 351 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PQ72 361 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 UBL3O95164 117 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 RAF1P04049 648 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CORO6Q6QEF8 472 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 NAXDQ8IW45 347 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 NLKQ9UBE8 527 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 SULT2B1O00204 365 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CCNKO75909 580 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 LIFP15018 202 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CLRN1P58418 232 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 PITPNAQ00169 270 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 RAET1LQ5VY80 246 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 FCRLAQ7L513 359 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 RAMP1O60894 148 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ADRB1P08588 477 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 KLK2P20151 261 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 Q0VFX4 171 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 KRT74Q7RTS7 529 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ST7LQ8TDW4 575 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 MIB2Q96AX9 1013 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 DKKL1Q9UK85 242 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 SDK2Q58EX2 2172 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 AQP8O94778 261 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 NR4A2P43354 598 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 PCK2Q16822 640 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CARD17Q5XLA6 110 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 MCHR2Q969V1 340 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CAMK2AQ9UQM7 478 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ATP6V1G1O75348 118 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 IGHG1P01857 330 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ICAM2P13598 275 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZNF43P17038 809 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 SLC35A1P78382 337 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 DGCR2P98153 550 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 THEM4Q5T1C6 240 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CMTM3Q96MX0 182 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 OXGR1Q96P68 337 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 DDA1Q9BW61 102 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ABCG5Q9H222 651 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TMEM165Q9HC07 324 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CENPMQ9NSP4 180 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PPL8 197 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 C9orf172C9J069 976 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 HRGP04196 525 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CD3GP09693 182 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 FAM157BP0CG42 384 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 PGA4P0DJD7 388 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 PGA3P0DJD8 388 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms