RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492294.5

PNISR-209, Transcript of PNN interacting serine and arginine rich protein, human

TSL 3

Gene PNISR, Length 652 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNISR-209	ENST00000492294	ZP1	P60852	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	LCP2	Q13094	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	CHIT1	Q13231	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	PTGR1	Q14914	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	PDK4	Q16654	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ITM2A	O43736	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	UTS2	O95399	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	GBA	P04062	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	GYPC	P04921	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	TPM3	P06753	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	FGF2	P09038	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	TPM1	P09493	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	GABRA5	P31644	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	CD80	P33681	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	TGFBR2	P37173	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	PHEX	P78562	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	CCL8	P80075	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNISR-209	ENST00000492294	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294		A0A1W2PPW3	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	HSPA12A	O43301	675 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	MBD3	O95983	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	CPT2	P23786	658 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	GLRX	P35754	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	IER3	P46695	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	ENTPD1	P49961	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	EFNB2	P52799	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	TERF1	P54274	439 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	CUL3	Q13618	768 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	HNF4G	Q14541	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNISR-209	ENST00000492294	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms