RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM71Q6P5X7 295 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDDC2Q7Z4H3 204 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYS1Q8N2H4 156 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF676Q8N7Q3 588 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R14AQ96A00 147 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSX2Q9BZM3 304 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMP25Q9NPA2 562 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD10Q9NXR5 420 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMP5Q9UJQ1 280 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXL2Q9UKC9 423 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM4BO94953 1096 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD53P19397 219 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCTDP32321 178 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF4P78317 190 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEP1BQ16820 701 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSG1Q2KHT4 349 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2T4Q8NH00 348 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C20orf85Q9H1P6 137 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PILRBQ9UKJ0 227 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICAM5Q9UMF0 924 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAMK2AQ9UQM7 478 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 V9GY05 133 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRG2CA6NGY1 282 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM74A7A6NL05 159 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLCEO94923 617 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SQSTM1Q13501 440 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC01590Q5TEZ4 76 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLITRK4Q8IW52 837 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDFY1Q8IWB7 410 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC36Q8IYA8 594 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2T35Q8NGX2 323 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5AK2Q8NH90 309 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFI44Q8TCB0 444 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A38Q96DW6 304 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1F2PQ96R84 312 aa13.98□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GTQ1 180 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMTOR5O43504 91 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GATBO75879 557 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZP3P21754 424 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SELENOPP49908 381 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2NLQ5JXB2 153 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF20Q5VT98 475 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFAP2EQ6VUC0 442 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZTK2 550 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APCDD1LQ8NCL9 501 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NANPQ8TBE9 248 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSMAFQ92636 917 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDAQ92838 391 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL5BQ96KC2 179 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN32Q96QS1 320 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMELYQ99218 206 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRRS1LQ9P0K9 344 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM265A0A087WTH1 108 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR171O14626 319 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKR7A3O95154 331 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNASE1P24855 282 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR0B2Q15466 257 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A19Q695T7 634 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRN1Q6UXK5 716 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR6V1Q8N148 313 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB33BQ9H082 229 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5V1Q9UGF6 321 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMACHCQ9Y4U1 282 aa13.97□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F10P00742 488 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIST1H2ABP04908 130 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD14P08571 375 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK2P24941 298 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPS1P60891 318 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFA5Q01523 94 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL28A1Q2UY09 1125 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MESTQ5EB52 335 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COQ8AQ8NI60 647 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM4Q8WVI0 70 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIST1H2ACQ93077 130 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRB3Q9BUF7 120 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HRASLSQ9HDD0 168 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUSD2Q9UGT4 822 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MLXQ9UH92 298 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RARRES3Q9UL19 164 aa13.96□□□□□ -0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAB21L2Q9Y586 359 aa13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms