RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 LRRC18Q8N456 261 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR8G5Q8NG78 346 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR52I2Q8NH67 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TAAR8Q969N4 342 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PRRC1Q96M27 445 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR1F2PQ96R84 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 F2RL3Q96RI0 385 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 LMF1Q96S06 567 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MICU1Q9BPX6 476 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 DDA1Q9BW61 102 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 LAT2Q9GZY6 243 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NT5MQ9NPB1 228 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 COX16Q9P0S2 106 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MOKQ9UQ07 419 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 A0A0A6YYH2 397 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 A6NJ64 397 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 IFITM10A6NMD0 228 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PPP5D1E7EU14 171 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MASP2O00187 686 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 XRCC3O43542 346 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 GLCEO94923 617 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PPBPP02775 128 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RLN1P04808 185 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 C8GP07360 202 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 GALTP07902 379 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PET100P0DJ07 73 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR12D1P0DN82 309 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ATF1P18846 271 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MMP11P24347 488 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TACR1P25103 407 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 DPP4P27487 766 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ITPKBP27987 946 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 AKT2P31751 481 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CD80P33681 288 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR1E2P47887 323 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SULT1A1P50225 295 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 P2RX1P51575 399 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 LIM2P55344 173 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ACTA2P62736 377 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RANP62826 216 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ACTG2P63267 376 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PRDX4Q13162 271 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SKP2Q13309 424 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SHHQ15465 462 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 UBE2V2Q15819 145 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 AWAT1Q58HT5 328 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ULK3Q6PHR2 472 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 LCTLQ6UWM7 567 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PKP4-211ENST00000481115 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NEK7Q8TDX7 302 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MYLIPQ8WY64 445 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SMARCD2Q92925 531 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 FBXO32Q969P5 355 aa6.49□□□□□ -1.37
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