RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF416Q9BWM5 594 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 IKZF5Q9H5V7 419 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF726A6NNF4 738 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 T-ENOLP0DO92 83 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 IDO1P14902 403 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ETS2P15036 469 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MAKP20794 623 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 AHCYP23526 432 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 CRYBB2P43320 205 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 CSNK1A1P48729 337 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 NCALDP61601 193 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 GALK2Q01415 458 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 GLO1Q04760 184 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 PMS2P3Q13401 168 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 NPTX1Q15818 432 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 FAM91A1Q658Y4 838 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 REP15Q6BDI9 236 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ULK3Q6PHR2 472 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 USP51Q70EK9 711 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 PXKQ7Z7A4 578 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 OR4D11Q8NGI4 311 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF747Q9BV97 191 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 RMND5AQ9H871 391 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 GLTPQ9NZD2 209 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM247A6NEH6 219 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 M0R3H8 397 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 GYG2O15488 501 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 DHHO43323 396 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS23O95084 383 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ADORA3P0DMS8 318 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 AQP1P29972 269 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MPV17P39210 176 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 LIMS1P48059 325 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MXRA7P84157 204 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 CDK6Q00534 326 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 RBBP4Q09028 425 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZP4Q12836 540 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 FADDQ13158 208 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 GCNT6Q5T4J0 391 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 EPGNQ6UW88 154 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 OR5J2Q8NH18 312 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 OR6X1Q8NH79 312 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 STON2Q8WXE9 905 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MCUR1Q96AQ8 359 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC58Q96CX6 371 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 DUX5Q96PT3 197 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 BTBD10Q9BSF8 475 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF696Q9H7X3 374 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 VAPAQ9P0L0 249 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms