RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FAM3CQ92520 227 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 APOOQ9BUR5 198 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SGPP1Q9BX95 441 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM129A0AVI4 362 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PAPLNO95428 1278 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 WNT11O96014 354 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 S100A8P05109 93 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 AADACP22760 399 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HCCSP53701 268 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ERV3-1Q14264 604 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SYT13Q7L8C5 426 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CTXN2P0C2S0 81 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SRMP19623 302 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD6Q9BV23 337 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CHST8Q9H2A9 424 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PIGMQ9H3S5 423 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GDE1Q9NZC3 331 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CEBPBP17676 345 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DL3P43628 341 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DS4P43632 304 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DS1Q14954 304 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FRMD1Q8N878 549 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TIMD4Q96H15 378 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C12orf57Q99622 126 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 MYO7AQ13402 2215 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GTL3 188 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SLCO2B1O94956 709 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR13C7P0DN81 318 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 F2RP25116 425 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR1D4P47884 311 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 EVX1P49640 407 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2G1P62253 170 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMED6Q8WW62 240 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 YIPF5Q969M3 257 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF566Q969W8 418 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35E1Q96K37 410 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OPALINQ96PE5 141 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ15Q99712 375 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GWA3 101 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TO15178 435 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 PMS2P2O95744 297 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CHRM2P08172 466 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 FPR3P25089 353 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 MEP1BQ16820 701 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 MDGA2Q7Z553 956 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.15□□□□□ -1.11
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