RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 MESTQ5EB52 335 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 RASD2Q96D21 266 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 PIMREGQ9BSJ6 248 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 TPK1Q9H3S4 243 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 REV1Q9UBZ9 1251 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 IL20RAQ9UHF4 553 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP13Q9UII6 198 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAM21Q9UKJ8 722 aa17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 VWC2LB2RUY7 222 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 NDUFS8O00217 210 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SNAP29O95721 258 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 DAOP14920 347 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 USF1P22415 310 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM249Q2WGJ8 235 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2R1Q6VVX0 501 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 THSD4Q6ZMP0 1018 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 AKR7LQ8NHP1 331 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXN4Q96NZ1 517 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 GPA33Q99795 319 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 YAE1D1Q9NRH1 226 aa17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PPW3 197 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 PRSS37A4D1T9 235 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 LCKP06239 509 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CST2P09228 141 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP6V1B2P21281 511 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 MSR1P21757 451 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNOP22674 350 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 STOMP27105 288 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RRM2P31350 389 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH3B1P43353 468 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 NR4A2P43354 598 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 FXYD6P3P58550 94 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVS71-1P61550 626 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 PSG4Q00888 419 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 GGTLC2Q14390 218 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR139Q6DWJ6 353 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ZER1Q7Z7L7 766 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2H1Q9GZK4 316 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 IL1RAPQ9NPH3 570 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 NRIP3Q9NQ35 241 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 POLE4Q9NR33 117 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 AHCYL1O43865 530 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SDHAP31040 664 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD52P43351 418 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 UCP2P55851 309 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 PCBD1P61457 104 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RINLQ6ZS11 566 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ICA1LQ8NDH6 482 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 POM121L2Q96KW2 1035 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF416Q9BWM5 594 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 WNT5BQ9H1J7 359 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 MS4A5Q9H3V2 200 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 EMC7Q9NPA0 242 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTR3BQ9P1U1 418 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 TMCC3Q9ULS5 477 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SOCS2O14508 198 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 OR10H3O60404 316 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 STAMBPO95630 424 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CLPTM1O96005 669 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SCG5P05408 212 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CTLA4P16410 223 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CALB2P22676 271 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 GDI2P50395 445 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ALKBH6Q3KRA9 238 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SMARCD3Q6STE5 483 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT2A3Q6UWM9 527 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP24Q8N264 748 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNPRQ8TBG9 265 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 FANK1Q8TC84 345 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 UBASH3BQ8TF42 649 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 C11orf40Q8WZ69 217 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 BCL2L14Q9BZR8 327 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SYT4Q9H2B2 425 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RERGLQ9H628 205 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC100509620A0A075B734 347 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 C5orf49A4QMS7 147 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 C12orf71A8MTZ7 269 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 IMPA2O14732 288 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R3DO95685 299 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 T-ENOLP0DO92 83 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 NAT2P11245 290 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF250P15622 560 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS6KA3P51812 740 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SELENOVP59797 346 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD39-201ENST00000393537 NKPD1Q17RQ9 610 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms