RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BSGP35613 385 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TGM4P49221 684 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCNG1P51959 295 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AQP4P55087 323 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACTBP60709 375 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACTG1P63261 375 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CSNK1G2P78368 415 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC7A5Q01650 507 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MGAT2Q10469 447 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SKP2Q13309 424 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPP1R1AQ13522 171 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STAT4Q14765 748 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OPCMLQ14982 345 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MTERF2Q49AM1 385 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM229BQ4G0N7 80 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM106AQ4KMX7 169 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ODF2Q5BJF6 829 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HES5Q5TA89 166 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC25A24Q6NUK1 477 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CFAP77Q6ZQR2 320 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NLRP14Q86W24 1093 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TICAM2Q86XR7 235 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF280BQ86YH2 543 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRIM59Q8IWR1 403 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C9orf40Q8IXQ3 194 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 THNSL1Q8IYQ7 743 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ELMOD1Q8N336 334 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC30BQ8N4P2 665 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 METTL25Q8N6Q8 603 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF676Q8N7Q3 588 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCAIQ8N9R8 606 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C3orf58Q8NDZ4 430 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTLQ8NG68 377 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR52I1Q8NGK6 324 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR6K6Q8NGW6 343 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AKR7LQ8NHP1 331 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC8Q8TAM2 541 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FANK1Q8TC84 345 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 YIPF5Q969M3 257 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLT1D1Q96MS3 346 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DEPDC7Q96QD5 511 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TWNKQ96RR1 684 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IFT27Q9BW83 186 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR2B2Q9GZK3 357 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HAUS4Q9H6D7 363 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BRD9Q9H8M2 597 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SFXN1Q9H9B4 322 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLGRKTQ9HBL7 147 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BPIFA1Q9NP55 256 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FGF21Q9NSA1 209 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NRBP2Q9NSY0 501 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0A0MQY5 61 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A1W2PRB8 838 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLRN2A0PK11 232 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRRIQ4A6NIV6 560 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DHRS7CA6NNS2 312 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 E9PI62 339 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCSO14618 274 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC16A6O15403 523 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RP2O75695 350 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNAPINO95295 136 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBED1O96006 694 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NRASP01111 189 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HRASP01112 189 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRASP01116 189 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGF1P05019 195 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GJB1P08034 283 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ICAM2P13598 275 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF30P17039 623 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERCC3P19447 782 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MUTP22033 750 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRYBB3P26998 211 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 YWHAQP27348 245 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GCAP28676 217 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PSMB10P40306 273 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCR9P51686 369 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LIM2P55344 173 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPL32P62910 135 aaKnown RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 INCA1Q0VD86 236 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EDDM3AQ14507 147 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLCA4Q14CN2 919 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 METTL11BQ5VVY1 283 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CST9LP1Q5W188 147 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SIGIRRQ6IA17 410 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DEGS2Q6QHC5 323 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RTL4Q6ZR62 310 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa-2.91□□□□□ -2.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms