RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHA1P01876 353 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPRM1P35372 400 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBA4AP68366 448 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM154Q6P9G4 183 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATCAYQ86WG3 371 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAXEQ8NCW5 288 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 STARD4Q96DR4 205 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM38BQ9NVV0 291 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNG2Q9UJ96 466 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZGRF1Q86YA3 2104 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 J3QRE1 110 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLPTM1O96005 669 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCCSP53701 268 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNMB1Q16558 191 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPY19L4Q7Z388 723 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 LHFPL3Q86UP9 236 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 RND1Q92730 232 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 JAM3Q9BX67 310 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 EMC7Q9NPA0 242 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEMO1Q9Y316 297 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYL12BO14950 172 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 FARS2O95363 451 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM18P0DKX4 95 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPGP29372 298 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf135Q5VTT2 229 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTPQ5XKR4 325 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC20BQ86Y33 519 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIGLEC11Q96RL6 698 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIAEQ9HAT2 523 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVK13-1Q9NX77 482 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOCK7Q96N67 2140 aa24.14■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHYHO14832 338 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETV1P50549 477 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSM6P62312 80 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARF1P84077 181 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX30Q5JUR7 227 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNLSQ5VYX0 342 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC18B1Q6NT16 456 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF813Q6ZN06 617 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZT83 130 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF454Q8N9F8 522 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTOSQ8NHW6 89 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 THEM6Q8WUY1 208 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 MND1Q9BWT6 205 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNN2Q9H2S1 579 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R16Q9NYV7 291 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0G2JNJ9 132 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL21O00585 134 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC14L2O76054 403 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL18BPO95998 194 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD8BP10966 210 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4GALT1P15291 398 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS27P42677 84 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 TGFBR3Q03167 851 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD8Q6ZWB6 473 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTRA1Q92743 480 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 DMRTA2Q96SC8 542 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q9UFV3 132 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCG5P05408 212 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADRA2AP08913 450 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8G3PP0DMU2 310 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP2K4P45985 399 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALEQ14376 348 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRN1LQ496H8 165 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEND4Q6ZU67 534 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC18Q8N456 261 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A24Q8N4F4 322 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL36Q8N4N3 616 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF610Q8N9Z0 462 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX33Q8WV41 574 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 NABP1Q96AH0 204 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG8Q9BVK2 526 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGMQ9H3S5 423 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC2DQ9UHP7 191 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHANK1Q9Y566 2161 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 CGAP01215 116 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLE1Q04724 770 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRF3Q14653 427 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEDD8Q15843 81 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM27BQ5VT28 67 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00346Q8IVM7 164 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALNT11Q8NCW6 608 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB17Q8WXJ9 295 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOT13Q9NPJ3 140 aa24.11■■□□□ 1.45
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