RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 LRRC46Q96FV0 321 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 UBQLN4Q9NRR5 601 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 LRP4O75096 1905 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 NDUFA2O43678 99 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CA3P07451 260 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TACR3P29371 465 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GPM6BQ13491 265 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CLVS2Q5SYC1 327 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TMEM225Q6GV28 225 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 OOSP2Q86WS3 158 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SLC41A2Q96JW4 573 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SEMA6CQ9H3T2 930 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TMEM185BQ9H7F4 350 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PLCL2Q9UPR0 1127 aa13.46□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GW55 424 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 FAM74A7A6NL05 159 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF264O43296 627 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PLATP00750 562 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 HLA-DQA2P01906 255 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DUX4L2P0CJ85 424 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DUX4L3P0CJ86 424 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DUX4L4P0CJ87 422 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DUX4L5P0CJ88 424 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DUX4L6P0CJ89 424 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DUX4L7P0CJ90 424 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 FGL1Q08830 312 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DHRS2Q13268 280 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PRTGQ2VWP7 1150 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TEX30Q5JUR7 227 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF563Q8TA94 476 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 RNF128Q8TEB7 428 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MARC2Q969Z3 335 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 NPAS1Q99742 590 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DUX4Q9UBX2 424 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TNFSF18Q9UNG2 199 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CLDN4O14493 209 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 HTR2CP28335 458 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 LUMP51884 338 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DEFA5Q01523 94 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CCINQ13939 588 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GLT8D1Q68CQ7 371 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ELP2Q6IA86 826 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 NDUFAF7Q7L592 441 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TAF8Q7Z7C8 310 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CLRN3Q8NCR9 226 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 BPIFCQ8NFQ6 507 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 OR10Z1Q8NGY1 313 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GPBAR1Q8TDU6 330 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ASB5Q8WWX0 329 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF75AQ96N20 296 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 EDEM2Q9BV94 578 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF416Q9BWM5 594 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TAS2R4Q9NYW5 299 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TAS2R3Q9NYW6 316 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 B9D1Q9UPM9 204 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DHDHQ9UQ10 334 aa13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PPC1 479 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 C11orf98E9PRG8 122 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SCDO00767 359 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DOK2O60496 412 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 STARP49675 285 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ARHGDIBP52566 201 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF345Q14585 488 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GLYATL3Q5SZD4 288 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 C11orf87Q6NUJ2 197 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 Q6ZSR6 202 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 OR13C8Q8NGS7 320 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PTDSS2Q9BVG9 487 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SCPEP1Q9HB40 452 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MSRAQ9UJ68 235 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CACNA1CQ13936 2221 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ALPK2Q86TB3 2170 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MPTX1A8MV57 137 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 BCL2L11O43521 198 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GMFGO60234 142 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 UTS2O95399 124 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SLC25A4P12235 298 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CNR1P21554 472 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CD34P28906 385 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms