RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SNX33Q8WV41 574 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 S100ZQ8WXG8 99 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PELI1Q96FA3 418 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TM9SF2Q99805 663 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 A0A1B0GUH1 482 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 VAMP5O95183 116 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 HLA-DQA2P01906 255 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GAAP10253 952 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 LHX2P50458 406 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CARD18P57730 90 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 FABP5Q01469 135 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CAMK2DQ13557 499 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GPR50Q13585 617 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SLC17A1Q14916 467 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 C4orf17Q53FE4 359 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 DNM1P34Q6PK57 102 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 RPTNQ6XPR3 784 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 DPY19L4Q7Z388 723 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SLC26A10Q8NG04 563 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OR10D3Q8NH80 312 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
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SRSF1-201ENST00000258962 COQ7Q99807 217 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 LDAHQ9H6V9 325 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ACOXLQ9NUZ1 547 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GNG8Q9UK08 70 aa15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 A0A1B0GTH9 108 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PSMD9O00233 223 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MPZL1O95297 269 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 IGHG1P01857 330 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ALOX5APP20292 161 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PER3P56645 1201 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CLDN17P56750 224 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CLRN1P58418 232 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TAS2R43P59537 309 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GLO1Q04760 184 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 HIST3H3Q16695 136 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MEP1BQ16820 701 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OTOSQ8NHW6 89 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 AMELYQ99218 206 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TMED9Q9BVK6 235 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MMP27Q9H306 513 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 EXO5Q9H790 373 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TENM4Q6N022 2769 aa15.47■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CLEC18AA5D8T8 446 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PRRG2O14669 202 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OGG1O15527 345 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PLPP2O43688 288 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ABHD16AO95870 558 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CLDN18P56856 261 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.071e-10■■■□□ 18.1
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 THEM4Q5T1C6 240 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CARD17Q5XLA6 110 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ARL9Q6T311 187 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZIC4Q8N9L1 334 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CLEC18CQ8NCF0 446 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 BORCS5Q969J3 196 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 HMG20AQ9NP66 347 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.46■□□□□ 0.07
SRSF1-201ENST00000258962 FLNCQ14315 2725 aa15.46■□□□□ 0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.46■□□□□ 0.06
SRSF1-201ENST00000258962 GTF3C1Q12789 2109 aa15.46■□□□□ 0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa15.45■□□□□ 0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF716A6NP11 495 aa15.45■□□□□ 0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CENPBD1B2RD01 187 aa15.45■□□□□ 0.06
SRSF1-201ENST00000258962 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.45■□□□□ 0.06
SRSF1-201ENST00000258962 NPIPA3F8WFD2 350 aa15.45■□□□□ 0.06
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