RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243077.7

LRP1-201, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 14,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-201ENST00000243077 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.3□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 ABCD3P28288 659 aa8.3□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 KIAA1024LP59773 190 aa8.3□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 C17orf99Q6UX52 265 aa8.3□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 USP53Q70EK8 1073 aa8.3□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 RNF175Q8N4F7 328 aa8.3□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 CHST14Q8NCH0 376 aa8.3□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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LRP1-201ENST00000243077 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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LRP1-201ENST00000243077 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.3□□□□□ -1.08
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LRP1-201ENST00000243077 DTX3Q8N9I9 347 aa8.29□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.29□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 NTN4Q9HB63 628 aa8.29□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 R4GMQ9 66 aa8.29□□□□□ -1.08
LRP1-201ENST00000243077 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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