RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TEX19Q8NA77 164 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR2A5Q96R48 311 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 IFNA6P05013 189 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GLI4P10075 376 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CD53P19397 219 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ID4P47928 161 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ARFIP1P53367 373 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CAMKVQ8NCB2 501 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NAXEQ8NCW5 288 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR2M4Q96R27 311 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ADOQ96SZ5 270 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GLS2Q9UI32 602 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CTDSPLO15194 276 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 HTR3BO95264 441 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SPP1P10451 314 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NPBWR1P48145 328 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CEBPGP53567 150 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 FOXL2P58012 376 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF425Q6IV72 752 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF584Q8IVC4 421 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DHDHQ9UQ10 334 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TXNL1O43396 289 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 HCRTR2O43614 444 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PMP2P02689 132 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 IL5P05113 134 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SERPINA5P05154 406 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GAAP10253 952 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ITGA3P26006 1051 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PPP1R1AQ13522 171 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 USP53Q70EK8 1073 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC107Q8WV48 283 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 HDAC8Q9BY41 377 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CST11Q9H112 138 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DUSP22Q9NRW4 184 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PRSS38A1L453 326 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RFPL4AA6NLU0 287 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SGCEO43556 437 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PNPP00491 289 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 C5AR1P21730 350 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MPGP29372 298 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CSF2RBP32927 897 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PDZK1IP1Q13113 114 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 AVL9Q8NBF6 648 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 Q9N2J8 555 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GPR85P60893 370 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GAB4Q2WGN9 574 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF208O43345 1280 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 UPK3AO75631 287 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 WNT11O96014 354 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 DAOP14920 347 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 NME2P22392 152 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 FHL1Q13642 323 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 LCN10Q6JVE6 187 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 PRSS35Q8N3Z0 413 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 LPAR4Q99677 370 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 JAM3Q9BX67 310 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 FAM60AQ9NP50 221 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 S100A6P06703 90 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 CD226Q15762 336 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 NPRL2Q8WTW4 380 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-201ENST00000075430 INTS14Q96SY0 518 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms