RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN6-218ENST00000637223 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN6-218ENST00000637223 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN6-218ENST00000637223 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLN6-218ENST00000637223 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN6-218ENST00000637223 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 RNF181Q9P0P0 153 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 TAF1P21675 1872 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 MYH3P11055 1940 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 SNED1Q8TER0 1413 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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CLN6-218ENST00000637223 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 GPSM2P81274 684 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
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CLN6-218ENST00000637223 MPNDQ8N594 471 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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CLN6-218ENST00000637223 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 SRGAP3O43295 1099 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.46■■□□□ 1.03
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CLN6-218ENST00000637223 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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CLN6-218ENST00000637223 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.46■■□□□ 1.03
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CLN6-218ENST00000637223 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN6-218ENST00000637223 MTX1Q13505 466 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 CRBNQ96SW2 442 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 PSMD1Q99460 953 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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CLN6-218ENST00000637223 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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CLN6-218ENST00000637223 CHRNDQ07001 517 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 LRRC24Q50LG9 513 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 XDHP47989 1333 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 C6orf229H3BNL8 230 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 UFL1O94874 794 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 ATP8B2P98198 1209 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 CEP85Q6P2H3 762 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.42■■□□□ 1.02
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CLN6-218ENST00000637223 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.42■■□□□ 1.02
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CLN6-218ENST00000637223 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 SIL1Q9H173 461 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 POLLQ9UGP5 575 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 GGA1Q9UJY5 639 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.41■■□□□ 1.02
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CLN6-218ENST00000637223 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.41■■□□□ 1.02
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CLN6-218ENST00000637223 PCNTO95613 3336 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 EYA2O00167 538 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 TAF5LO75529 589 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN6-218ENST00000637223 PPIP5K2O43314 1243 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 ATP2B4P23634 1241 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 POLA2Q14181 598 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 AOC3Q16853 763 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 COPRSQ9NQ92 184 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 SNAP23O00161 211 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 RIMBP2O15034 1052 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLN6-218ENST00000637223 KCNJ4P48050 445 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLN6-218ENST00000637223 METTL24Q5JXM2 366 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 SSH3Q8TE77 659 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 SBF1O95248 1867 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLN6-218ENST00000637223 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.37■■□□□ 1.01
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CLN6-218ENST00000637223 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.36■■□□□ 1.01
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CLN6-218ENST00000637223 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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CLN6-218ENST00000637223 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 VPS33BQ9H267 617 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 FBXO3Q9UK99 471 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 COL4A5P29400 1685 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN6-218ENST00000637223 KLRK1P26718 216 aa21.34■■□□□ 1.01
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