RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622457.1

LTBP4-238, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	GCKR	Q14397	625 aa		15	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457		A0A1B0GUL6	1792 aa		15	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457		H7C1W4	665 aa		14.99	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		14.99	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	SLC51A	Q86UW1	340 aa		14.99	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	SP8	Q8IXZ3	490 aa		14.99	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		14.99	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	CASP7	P55210	303 aa		14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	CTSW	P56202	376 aa		14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	BEND3	Q5T5X7	828 aa		14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	VPS33B	Q9H267	617 aa		14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		14.98	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457		F6X3S4	739 aa		14.97	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	ALDH1L1	O75891	902 aa		14.97	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	14.97	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		14.97	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		14.96	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		14.96	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	PSME4	Q14997	1843 aa		14.96	□□□□□ -0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	EPS15	P42566	896 aa		14.95	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	ECE1	P42892	770 aa		14.95	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		14.95	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		14.95	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		14.94	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	FZD9	O00144	591 aa		14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	GRM8	O00222	908 aa		14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	MAP2K2	P36507	400 aa		14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	DLK2	Q6UY11	383 aa		14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	MPND	Q8N594	471 aa		14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	UTY	O14607	1347 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	KIF16B	Q96L93	1317 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	CSF1R	P07333	972 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	JDP2	Q8WYK2	163 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		14.92	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SCNN1D	P51172	638 aa		14.91	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		14.91	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		14.91	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		14.91	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	GREM2	Q9H772	168 aa		14.91	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	PPIP5K2	O43314	1243 aa		14.9	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		14.9	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		14.9	□□□□□ -0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NIM1K	Q8IY84	436 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	SCN9A	Q15858	1988 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ITGA6	P23229	1130 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	GPSM2	P81274	684 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	FOXO4	P98177	505 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	AOC3	Q16853	763 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	GPC2	Q8N158	579 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	EYA3	Q99504	573 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	XDH	P47989	1333 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		14.87	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	CA12	O43570	354 aa		14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	POLL	Q9UGP5	575 aa		14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	GGA1	Q9UJY5	639 aa		14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNF609	O15014	1411 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	WASHC4	Q2M389	1173 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		14.85	□□□□□ -0.03

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