RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597816.5

LTBP4-218, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene LTBP4, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-218ENST00000597816 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.36■□□□□ 0.85
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LTBP4-218ENST00000597816 FAM161AQ3B820 660 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-218ENST00000597816 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-218ENST00000597816 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.36■□□□□ 0.85
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LTBP4-218ENST00000597816 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBP4-218ENST00000597816 SUCLG2Q96I99 432 aa20.32■□□□□ 0.84
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LTBP4-218ENST00000597816 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.32■□□□□ 0.84
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LTBP4-218ENST00000597816 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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LTBP4-218ENST00000597816 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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LTBP4-218ENST00000597816 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LTBP4-218ENST00000597816 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LTBP4-218ENST00000597816 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LTBP4-218ENST00000597816 SPEF2Q9C093 1822 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBP4-218ENST00000597816 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.27■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 MED23Q9ULK4 1368 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 H7C1D1 291 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 BCAR3O75815 825 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 KCNJ4P48050 445 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 CNTROBQ8N137 903 aa20.24■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.24■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 COA1Q9GZY4 146 aa20.24■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.24■□□□□ 0.83
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LTBP4-218ENST00000597816 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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LTBP4-218ENST00000597816 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.22■□□□□ 0.83
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LTBP4-218ENST00000597816 MICALL2Q8IY33 904 aa20.22■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.22■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 HTRA3P83110 453 aa20.21■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 IFFO2Q5TF58 517 aa20.21■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.21■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.21■□□□□ 0.83
LTBP4-218ENST00000597816 PASKQ96RG2 1323 aa20.21■□□□□ 0.83
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