RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.66□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.66□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 POLLQ9UGP5 575 aa14.66□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.66□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 SCN4AP35499 1836 aa14.65□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 SPEF2Q9C093 1822 aa14.65□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 HSPA6P17066 643 aa14.65□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 ATP2B4P23634 1241 aa14.65□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 TNIP1Q15025 636 aa14.65□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.65□□□□□ -0.06
GGA3-204ENST00000578208 LTBP1Q14766 1721 aa14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 POTECB2RU33 542 aa14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 FOXO4P98177 505 aa14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 ECE2O60344 883 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 RAD17O75943 681 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 EPHX2P34913 555 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 CXCL9Q07325 125 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 SUCLG2Q96I99 432 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 UTYO14607 1347 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 KCNJ4P48050 445 aa14.62□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 DOK7Q18PE1 504 aa14.62□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 LDHDQ86WU2 507 aa14.62□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.62□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 APLP1P51693 650 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 CHADLQ6NUI6 762 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 MED23Q9ULK4 1368 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 YDJCA8MPS7 323 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 SCNN1DP51172 638 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 CHRNDQ07001 517 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 USP44Q9H0E7 712 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-204ENST00000578208 PSMD14O00487 310 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 POTEIP0CG38 1075 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 POTEJP0CG39 1038 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 H7C1D1 291 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 BCAR3O75815 825 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 EPS15P42566 896 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 PODNQ7Z5L7 613 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 PLIN1O60240 522 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 DPF2Q92785 391 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 KAZALD1Q96I82 304 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 COA1Q9GZY4 146 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 TAF5LO75529 589 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 GNAI3P08754 354 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 TRIM27P14373 513 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 MICALL2Q8IY33 904 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 FBXW7Q969H0 707 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 USP17L3A6NCW0 530 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 USP17L4A6NCW7 530 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 A0A1B0GUL6 1792 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GGA3-204ENST00000578208 CNTROBQ8N137 903 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms