RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.61■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 XDHP47989 1333 aa26.61■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 G3V3G9 751 aa26.6■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 FOXO4P98177 505 aa26.6■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.6■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 TNIP1Q15025 636 aa26.59■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
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SNAP23-216ENST00000568331 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.58■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.58■■□□□ 1.85
SNAP23-216ENST00000568331 ATP2B4P23634 1241 aa26.57■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 EPHX2P34913 555 aa26.57■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.57■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 RAD17O75943 681 aa26.56■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.56■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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SNAP23-216ENST00000568331 DOK7Q18PE1 504 aa26.55■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.55■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.55■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.55■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 ECE2O60344 883 aa26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 APLP1P51693 650 aa26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 CHADLQ6NUI6 762 aa26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 LDHDQ86WU2 507 aa26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 SUCLG2Q96I99 432 aa26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 UTYO14607 1347 aa26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 KIF16BQ96L93 1317 aa26.54■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 YDJCA8MPS7 323 aa26.53■■□□□ 1.84
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SNAP23-216ENST00000568331 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.53■■□□□ 1.84
SNAP23-216ENST00000568331 SCNN1DP51172 638 aa26.52■■□□□ 1.84
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SNAP23-216ENST00000568331 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.51■■□□□ 1.83
SNAP23-216ENST00000568331 EPS15P42566 896 aa26.5■■□□□ 1.83
SNAP23-216ENST00000568331 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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SNAP23-216ENST00000568331 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.49■■□□□ 1.83
SNAP23-216ENST00000568331 USP44Q9H0E7 712 aa26.49■■□□□ 1.83
SNAP23-216ENST00000568331 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.49■■□□□ 1.83
SNAP23-216ENST00000568331 MED23Q9ULK4 1368 aa26.48■■□□□ 1.83
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SNAP23-216ENST00000568331 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.48■■□□□ 1.83
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SNAP23-216ENST00000568331 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.46■■□□□ 1.83
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SNAP23-216ENST00000568331 BCAR3O75815 825 aa26.45■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.45■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.45■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 SCN9AQ15858 1988 aa26.45■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 PSME4Q14997 1843 aa26.44■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 H7C1D1 291 aa26.44■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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SNAP23-216ENST00000568331 PODNQ7Z5L7 613 aa26.44■■□□□ 1.82
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SNAP23-216ENST00000568331 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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SNAP23-216ENST00000568331 PLIN1O60240 522 aa26.42■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 TAF5LO75529 589 aa26.42■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.41■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 MICALL2Q8IY33 904 aa26.41■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 COA1Q9GZY4 146 aa26.41■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 CNTROBQ8N137 903 aa26.4■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 USP17L3A6NCW0 530 aa26.39■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 USP17L4A6NCW7 530 aa26.39■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.39■■□□□ 1.82
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM27P14373 513 aa26.38■■□□□ 1.81
SNAP23-216ENST00000568331 HTRA3P83110 453 aa26.38■■□□□ 1.81
SNAP23-216ENST00000568331 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.38■■□□□ 1.81
SNAP23-216ENST00000568331 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SNAP23-216ENST00000568331 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.38■■□□□ 1.81
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