RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	WASHC4	Q2M389	1173 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	CHADL	Q6NUI6	762 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	LTBP1	Q14766	1721 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RBM23-231	ENST00000557549	YDJC	A8MPS7	323 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	RAD17	O75943	681 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	EPS15	P42566	896 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	SCNN1D	P51172	638 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	RTL9	Q8NET4	1388 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	SPEF2	Q9C093	1822 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	GRM8	O00222	908 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	CSF1R	P07333	972 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	LDHD	Q86WU2	507 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	DOK7	Q18PE1	504 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	UTY	O14607	1347 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	UFL1	O94874	794 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	FOXO4	P98177	505 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	FAM161A	Q3B820	660 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	EYA3	Q99504	573 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	GGA1	Q9UJY5	639 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	ECE2	O60344	883 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	ITGA6	P23229	1130 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	TNIP1	Q15025	636 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	XDH	P47989	1333 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	SHTN1	A0MZ66	631 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	PSMD14	O00487	310 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RBM23-231	ENST00000557549	SCN9A	Q15858	1988 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	PASK	Q96RG2	1323 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	BCAR3	O75815	825 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ATP2B4	P23634	1241 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CNTROB	Q8N137	903 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549		G3V3G9	751 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	KLRG1	Q96E93	195 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	KAZALD1	Q96I82	304 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	USP44	Q9H0E7	712 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM27	P14373	513 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	15.49	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SUCLG2	Q96I99	432 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	MICALL2	Q8IY33	904 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SNAP23	O00161	211 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CHRND	Q07001	517 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	DPF2	Q92785	391 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CREBZF	Q9NS37	354 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		15.47	■□□□□ 0.07

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