RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 HMMRO75330 724 aa22.27■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 VPS33BQ9H267 617 aa22.27■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 GGA1Q9UJY5 639 aa22.27■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 G3V3G9 751 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 RASSF7Q02833 373 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 JDP2Q8WYK2 163 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 RNF181Q9P0P0 153 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 FBXO3Q9UK99 471 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 ATP2B4P23634 1241 aa22.25■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 LTBP1Q14766 1721 aa22.25■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 NFKBIEO00221 500 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 UFL1O94874 794 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 MTX1Q13505 466 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 AAMPQ13685 434 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 OLFM4Q6UX06 510 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 PPIP5K2O43314 1243 aa22.23■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.23■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.23■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.23■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.23■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.23■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 GPSM2P81274 684 aa22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 CHRNDQ07001 517 aa22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 METTL24Q5JXM2 366 aa22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 NIM1KQ8IY84 436 aa22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 COL4A1P02462 1669 aa22.22■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 ATP8B2P98198 1209 aa22.21■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 WASHC4Q2M389 1173 aa22.21■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.21■■□□□ 1.15
BRF1-209ENST00000547052 EYA2O00167 538 aa22.2■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 CIAO1O76071 339 aa22.2■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 SIL1Q9H173 461 aa22.2■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 COPRSQ9NQ92 184 aa22.2■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.19■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.19■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 SNED1Q8TER0 1413 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 CEP85Q6P2H3 762 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 CRBNQ96SW2 442 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 MED23Q9ULK4 1368 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 PSME4Q14997 1843 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 YY1P25490 414 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 AOC3Q16853 763 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 RIMBP2O15034 1052 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 NEFLP07196 543 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 UBE4AQ14139 1066 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 VPS37DQ86XT2 251 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 SSH3Q8TE77 659 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 POLLQ9UGP5 575 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-209ENST00000547052 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 TAF5LO75529 589 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 SLC5A1P13866 664 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 POLA2Q14181 598 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 LRRC24Q50LG9 513 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 PDE8BO95263 885 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 SCN4AP35499 1836 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 TNIP1Q15025 636 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 ATP2B3Q16720 1220 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 COA1Q9GZY4 146 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 ECE2O60344 883 aa22.09■■□□□ 1.13
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