RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SLC39A7Q92504 469 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 YY1AP1Q9H869 796 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 C7P10643 843 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 PTMSP20962 102 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 MCCP23508 829 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 TFCP2Q12800 502 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 NLRP10Q86W26 655 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 EVI5LQ96CN4 794 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 USP21Q9UK80 565 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 NUP98P52948 1817 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 SGSM2O43147 1006 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 KCNQ2O43526 872 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 GPTP24298 496 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 ITPK1Q13572 414 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 FAM89AQ96GI7 184 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-204ENST00000546621 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 EYA2O00167 538 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CIAO1O76071 339 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CSF1RP07333 972 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 NUBP1P53384 320 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ANAPC15P60006 121 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 HS1BP3Q53T59 392 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 IL25Q9H293 177 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 GPR108Q9NPR9 543 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 RAD50Q92878 1312 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 HIP1O00291 1037 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ATP5JP18859 108 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 IL17RAQ96F46 866 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ZNF609O15014 1411 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 NHSQ6T4R5 1651 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 MYH3P11055 1940 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ST18O60284 1047 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CAMTA2O94983 1202 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 TIE1P35590 1138 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 LRRC24Q50LG9 513 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 MAP3K13O43283 966 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 HSPA4P34932 840 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CTSWP56202 376 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 SYNE4Q8N205 404 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 METRNQ9UJH8 293 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 PALD1Q9ULE6 856 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 BCORQ6W2J9 1755 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 BTAF1O14981 1849 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ATRNO75882 1429 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 PDE8AO60658 829 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 DDIT3P35638 169 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 PARP10Q53GL7 1025 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 FAM212AQ96EL1 285 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 AK7Q96M32 723 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms