RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCN9AQ15858 1988 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C6orf229H3BNL8 230 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FSTL1Q12841 308 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GGA1Q9UJY5 639 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UFL1O94874 794 aa20.4■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.4■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.4■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SUCLG2Q96I99 432 aa20.4■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.4■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MED23Q9ULK4 1368 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP2B4P23634 1241 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KAZALD1Q96I82 304 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CXCL9Q07325 125 aa20.38■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP44Q9H0E7 712 aa20.38■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HACL1Q9UJ83 578 aa20.38■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.38■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YDJCA8MPS7 323 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF609O15014 1411 aa20.36■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSPA6P17066 643 aa20.36■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCNN1DP51172 638 aa20.36■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNIP1Q15025 636 aa20.36■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.36■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIMBP2O15034 1052 aa20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ECE2O60344 883 aa20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPHX2P34913 555 aa20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHRNDQ07001 517 aa20.34■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LDHDQ86WU2 507 aa20.34■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.34■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCAR3O75815 825 aa20.33■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAD17O75943 681 aa20.33■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIM27P14373 513 aa20.33■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.33■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.33■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.33■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.32■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHADLQ6NUI6 762 aa20.32■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.32■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DOK7Q18PE1 504 aa20.31■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.31■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 G3V3G9 751 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POTEIP0CG38 1075 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POTEJP0CG39 1038 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PODNQ7Z5L7 613 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PSMD14O00487 310 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPS15P42566 896 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APLP1P51693 650 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DPF2Q92785 391 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEP350Q5VT06 3117 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.28■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.28■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNJ4P48050 445 aa20.28■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COA1Q9GZY4 146 aa20.28■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.27■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.27■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GNAI3P08754 354 aa20.26■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MEIS3Q99687 375 aa20.26■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.26■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAF5LO75529 589 aa20.25■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.25■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.25■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP17L3A6NCW0 530 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms