RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.32■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 GCC1Q96CN9 775 aa15.32■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.32■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 SASH1O94885 1247 aa15.31■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.31■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 SIL1Q9H173 461 aa15.31■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.31■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.31■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 CHRNDQ07001 517 aa15.3■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.3■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.3■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 SNED1Q8TER0 1413 aa15.3■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.3■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.3■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 MYH3P11055 1940 aa15.29■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 SLC51AQ86UW1 340 aa15.29■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 GPR108Q9NPR9 543 aa15.29■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 PDE8BO95263 885 aa15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 GPSM2P81274 684 aa15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 SOGA3Q5TF21 947 aa15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 OLFM4Q6UX06 510 aa15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 KIF1BPQ96EK5 621 aa15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.28■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 UTRNP46939 3433 aa15.27■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 XDHP47989 1333 aa15.27■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 C21orf2O43822 256 aa15.27■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 FGFR2P21802 821 aa15.27■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 TFCP2Q12800 502 aa15.27■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 METTL24Q5JXM2 366 aa15.27■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.27■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 LEMD3Q9Y2U8 911 aa15.27■□□□□ 0.04
LMO3-217ENST00000537757 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 TAF5LO75529 589 aa15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 NUCB1Q02818 461 aa15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 UBE4AQ14139 1066 aa15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 BCS1LQ9Y276 419 aa15.26■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 ATP2B4P23634 1241 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 CCDC93Q567U6 631 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 MPNDQ8N594 471 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 PSMD1Q99460 953 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 POLLQ9UGP5 575 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 SLX4Q8IY92 1834 aa15.24■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 TNNI3KQ59H18 835 aa15.24■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 LPIN2Q92539 896 aa15.24■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 GGA1Q9UJY5 639 aa15.24■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.24■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.23■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 SNAP23O00161 211 aa15.23■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 ZBTB22O15209 634 aa15.23■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.23■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 VPS33BQ9H267 617 aa15.23■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 TAF1P21675 1872 aa15.23■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 LTBP3Q9NS15 1303 aa15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 TIMM10P62072 90 aa15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 ATP2B3Q16720 1220 aa15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.22■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 A0A1B0GUL7 405 aa15.21■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 APBB1O00213 710 aa15.21■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 NFKBIEO00221 500 aa15.21■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 UFL1O94874 794 aa15.21■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.21■□□□□ 0.03
LMO3-217ENST00000537757 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
LMO3-217ENST00000537757 SLC5A1P13866 664 aa15.2■□□□□ 0.02
LMO3-217ENST00000537757 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.2■□□□□ 0.02
LMO3-217ENST00000537757 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.2■□□□□ 0.02
LMO3-217ENST00000537757 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
LMO3-217ENST00000537757 LTBP1Q14766 1721 aa15.2■□□□□ 0.02
LMO3-217ENST00000537757 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.19■□□□□ 0.02
LMO3-217ENST00000537757 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms