RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	SRGAP3	O43295	1099 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	ATP8B2	P98198	1209 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	FAM161A	Q3B820	660 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	KAZALD1	Q96I82	304 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC93	Q567U6	631 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BBS1-224	ENST00000534730	CIAO1	O76071	339 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	CEP85	Q6P2H3	762 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	COPRS	Q9NQ92	184 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	18.94	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SSH3	Q8TE77	659 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	VPS33B	Q9H267	617 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	EYA2	O00167	538 aa		18.92	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	POLA2	Q14181	598 aa		18.92	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	MPND	Q8N594	471 aa		18.91	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		18.91	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		18.91	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	XDH	P47989	1333 aa		18.91	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	C21orf2	O43822	256 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	RAB11FIP3	O75154	756 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	CAPN15	O75808	1086 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ATP2B4	P23634	1241 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	KCNJ4	P48050	445 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	EYA3	Q99504	573 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		18.9	■□□□□ 0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SLX4	Q8IY92	1834 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PSMD1	Q99460	953 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	GGA1	Q9UJY5	639 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		18.89	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		18.88	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	POTEI	P0CG38	1075 aa		18.87	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	POTEJ	P0CG39	1038 aa		18.87	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	18.87	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	TNS4	Q8IZW8	715 aa		18.87	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		18.87	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CACNA1S	Q13698	1873 aa		18.86	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CHRND	Q07001	517 aa		18.86	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.86	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	GCC1	Q96CN9	775 aa		18.86	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	C6orf229	H3BNL8	230 aa		18.85	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		18.85	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		18.85	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	SIL1	Q9H173	461 aa		18.85	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		18.84	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PDE8B	O95263	885 aa		18.84	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	GPR108	Q9NPR9	543 aa		18.84	■□□□□ 0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		18.84	■□□□□ 0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms