RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-222ENST00000533557 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.05■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 SCARF1Q14162 830 aa16.04■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 KRT24Q2M2I5 525 aa16.04■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.04■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 SULF1Q8IWU6 871 aa16.04■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 FAM89AQ96GI7 184 aa16.04■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.04■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 UBE2Q2LH0YL09 131 aa16.03■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 TMC4Q7Z404 712 aa16.02■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 GMLQ99445 158 aa16.02■□□□□ 0.16
BBS1-222ENST00000533557 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 GPR25O00155 361 aa16.01■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.01■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 ISCA1Q9BUE6 129 aa16.01■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 TM4SF4P48230 202 aa15.99■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 POTEFA5A3E0 1075 aa15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 FKBP1BP68106 108 aa15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 EYA3Q99504 573 aa15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 MXD3Q9BW11 206 aa15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 HTTP42858 3142 aa15.97■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS1-222ENST00000533557 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 UFL1O94874 794 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 RIPK4P57078 832 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 ZNF609O15014 1411 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 NEFMP07197 916 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 USP17L8P0C7I0 530 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 FZD1Q9UP38 647 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 FKTNO75072 461 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 CAP1Q01518 475 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 CHL1O00533 1208 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 GGA1Q9UJY5 639 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 PRKG1Q13976 671 aa15.91■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 GCC1Q96CN9 775 aa15.91■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 USP17L3A6NCW0 530 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 USP17L4A6NCW7 530 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 G3V3G9 751 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 WNT10BO00744 389 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 BRCA2P51587 3418 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 CENPFP49454 3210 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.9■□□□□ 0.14
BBS1-222ENST00000533557 DACT2Q5SW24 774 aa15.89■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 SPRYD7Q5W111 196 aa15.89■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.89■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 SASH1O94885 1247 aa15.88■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.88■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.88■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 TRIM17Q9Y577 477 aa15.88■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 PODNQ7Z5L7 613 aa15.87■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.87■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 PSME4Q14997 1843 aa15.87■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 SREBF2Q12772 1141 aa15.86■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.86■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
BBS1-222ENST00000533557 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms