RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530474.5

TSTA3-212, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 823 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-212ENST00000530474 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-212ENST00000530474 KCNJ4P48050 445 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-212ENST00000530474 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-212ENST00000530474 GORABQ5T7V8 394 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-212ENST00000530474 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.173e-9■□□□□ 8.1
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TSTA3-212ENST00000530474 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-212ENST00000530474 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.12■□□□□ 0.17
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TSTA3-212ENST00000530474 LPIN2Q92539 896 aa16.12■□□□□ 0.17
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TSTA3-212ENST00000530474 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.12■□□□□ 0.17
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TSTA3-212ENST00000530474 ATP2B3Q16720 1220 aa16.09■□□□□ 0.17
TSTA3-212ENST00000530474 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.09■□□□□ 0.17
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TSTA3-212ENST00000530474 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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TSTA3-212ENST00000530474 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.05■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
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TSTA3-212ENST00000530474 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.04■□□□□ 0.16
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TSTA3-212ENST00000530474 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.04■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 KLHL34Q8N239 644 aa16.04■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 XAGE2Q96GT9 111 aa16.04■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 SEMA3EO15041 775 aa16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 DPEP1P16444 411 aa16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 TIMM10P62072 90 aa16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 CNTROBQ8N137 903 aa16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 A0A0G2JLW4 131 aa16.02■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 C6orf229H3BNL8 230 aa16.02■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 ZBTB22O15209 634 aa16.02■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TSTA3-212ENST00000530474 FGFR2P21802 821 aa16.02■□□□□ 0.16
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