RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 VIL1P09327 827 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 RIPK4P57078 832 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 DOK7Q18PE1 504 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 CDCA5Q96FF9 252 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 C6orf229H3BNL8 230 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 KRT24Q2M2I5 525 aa18.1■□□□□ 0.49
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PTPRU-209ENST00000526080 FAM89AQ96GI7 184 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 EYA3Q99504 573 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 CENPFP49454 3210 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 BRCA2P51587 3418 aa18.1■□□□□ 0.49
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PTPRU-209ENST00000526080 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 CHL1O00533 1208 aa18.07■□□□□ 0.48
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PTPRU-209ENST00000526080 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
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PTPRU-209ENST00000526080 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 GMLQ99445 158 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 HOXB7P09629 217 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 SCARF1Q14162 830 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 AGBL3Q8NEM8 1001 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 UFL1O94874 794 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-209ENST00000526080 MOB2Q70IA6 237 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 GGA1Q9UJY5 639 aa18.01■□□□□ 0.47
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PTPRU-209ENST00000526080 TM4SF4P48230 202 aa17.99■□□□□ 0.47
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PTPRU-209ENST00000526080 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.99■□□□□ 0.47
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PTPRU-209ENST00000526080 MED23Q9ULK4 1368 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 USP17L3A6NCW0 530 aa17.96■□□□□ 0.47
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PTPRU-209ENST00000526080 G3V3G9 751 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 GPR25O00155 361 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 NBPF9Q3BBW0 867 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC152Q4G0S7 254 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 DCAF8Q5TAQ9 597 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 USP17L1Q7RTZ2 530 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-209ENST00000526080 LAMB1P07942 1786 aa17.95■□□□□ 0.46
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PTPRU-209ENST00000526080 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.95■□□□□ 0.46
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PTPRU-209ENST00000526080 ATP2B4P23634 1241 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 NEUROD2Q15784 382 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC191Q8NCU4 936 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 WNT10BO00744 389 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 RIC3Q7Z5B4 369 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 MYD88Q99836 296 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 GOLGA2Q08379 1002 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 SREBF2Q12772 1141 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 RALBP1Q15311 655 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 MXD3Q9BW11 206 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRU-209ENST00000526080 MBIPQ9NS73 344 aa17.92■□□□□ 0.46
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