RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515332.5

SGMS2-209, Transcript of sphingomyelin synthase 2, human

TSL 3

Gene SGMS2, Length 498 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGMS2-209	ENST00000515332	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	EYA3	Q99504	573 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	RIPK4	P57078	832 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	SCN9A	Q15858	1988 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	KRT24	Q2M2I5	525 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SGMS2-209	ENST00000515332	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	SCARF1	Q14162	830 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332		G3V3G9	751 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SGMS2-209	ENST00000515332	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	UFL1	O94874	794 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	TBC1D8	O95759	1140 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	FKBP1B	P68106	108 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	GGA1	Q9UJY5	639 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF609	O15014	1411 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	CHL1	O00533	1208 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	GML	Q99445	158 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SGMS2-209	ENST00000515332	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		31.7	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	USP17L8	P0C7I0	530 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	NEUROD2	Q15784	382 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	PSME4	Q14997	1843 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	GPR25	O00155	361 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	USP17L3	A6NCW0	530 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	USP17L4	A6NCW7	530 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	TM4SF4	P48230	202 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	HYPK	Q9NX55	129 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SGMS2-209	ENST00000515332	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	HOXB7	P09629	217 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	XDH	P47989	1333 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	PODN	Q7Z5L7	613 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	FKTN	O75072	461 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	MXD3	Q9BW11	206 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SGMS2-209	ENST00000515332	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	ATP2B4	P23634	1241 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	SREBF2	Q12772	1141 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	MYD88	Q99836	296 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	PDE8A	O60658	829 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	NF2	P35240	595 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	GCC1	Q96CN9	775 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	WNT10B	O00744	389 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	PRKG1	Q13976	671 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	FBXW7	Q969H0	707 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	DACT2	Q5SW24	774 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SGMS2-209	ENST00000515332	OGFOD1	Q8N543	542 aa		31.53	■■■□□ 2.64

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