RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 EYA3Q99504 573 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 UFL1O94874 794 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 EGFRP00533 1210 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 SCN9AQ15858 1988 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.77□□□□□ -0.04
COPB2-211ENST00000513274 PDE8AO60658 829 aa14.77□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.77□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 SPEF2Q9C093 1822 aa14.77□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 RTL9Q8NET4 1388 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 DPF2Q92785 391 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 GGA1Q9UJY5 639 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.75□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 ADM5C9JUS6 153 aa14.75□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 G2E3Q7L622 706 aa14.75□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.75□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.75□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 IGKV5-2P06315 115 aa14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 HUNKP57058 714 aa14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 KSR2Q6VAB6 950 aa14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 ZIC5Q96T25 663 aa14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.74□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 MYH3P11055 1940 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 MAP2K2P36507 400 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 STK31Q9BXU1 1019 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 SLC4A2P04920 1241 aa14.72□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 WWC1Q8IX03 1113 aa14.72□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 ABHD8Q96I13 439 aa14.72□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 CTSWP56202 376 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 FBXW7Q969H0 707 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 GREM2Q9H772 168 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 GGA3Q9NZ52 723 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-211ENST00000513274 XDHP47989 1333 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 ATP2B4P23634 1241 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 SCARF1Q14162 830 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 MXD3Q9BW11 206 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 SULF1Q8IWU6 871 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 PSME4Q14997 1843 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 RGMBQ6NW40 437 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 MRS2Q9HD23 443 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 USP17L3A6NCW0 530 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 USP17L4A6NCW7 530 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 H7C1W4 665 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 USP17L8P0C7I0 530 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 NOGQ13253 232 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 CDCA5Q96FF9 252 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 FLIIQ13045 1269 aa14.66□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
COPB2-211ENST00000513274 CCDC27Q2M243 656 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms