RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC93Q567U6 631 aa24.96■■□□□ 1.59
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SMIM20-201ENST00000506197 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.95■■□□□ 1.58
SMIM20-201ENST00000506197 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.95■■□□□ 1.58
SMIM20-201ENST00000506197 WDR90Q96KV7 1748 aa24.95■■□□□ 1.58
SMIM20-201ENST00000506197 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SMIM20-201ENST00000506197 POLA2Q14181 598 aa24.94■■□□□ 1.58
SMIM20-201ENST00000506197 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.94■■□□□ 1.58
SMIM20-201ENST00000506197 ALDH1B1P30837 517 aa24.93■■□□□ 1.58
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SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.93■■□□□ 1.58
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SMIM20-201ENST00000506197 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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SMIM20-201ENST00000506197 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.88■■□□□ 1.57
SMIM20-201ENST00000506197 BBOX1O75936 387 aa24.87■■□□□ 1.57
SMIM20-201ENST00000506197 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
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SMIM20-201ENST00000506197 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.83■■□□□ 1.57
SMIM20-201ENST00000506197 GCC1Q96CN9 775 aa24.83■■□□□ 1.57
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SMIM20-201ENST00000506197 SCN4AP35499 1836 aa24.82■■□□□ 1.56
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SMIM20-201ENST00000506197 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.82■■□□□ 1.56
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SMIM20-201ENST00000506197 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.81■■□□□ 1.56
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SMIM20-201ENST00000506197 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.8■■□□□ 1.56
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SMIM20-201ENST00000506197 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.78■■□□□ 1.56
SMIM20-201ENST00000506197 SMC5Q8IY18 1101 aa24.77■■□□□ 1.56
SMIM20-201ENST00000506197 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.77■■□□□ 1.56
SMIM20-201ENST00000506197 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SMIM20-201ENST00000506197 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.76■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 HTRA3P83110 453 aa24.76■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 SLC51AQ86UW1 340 aa24.76■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.76■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.76■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 SASH1O94885 1247 aa24.75■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 TFCP2Q12800 502 aa24.75■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.75■■□□□ 1.55
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