RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.72■□□□□ 0.27
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.71■□□□□ 0.27
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PGGT1B-204ENST00000503638 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.68■□□□□ 0.26
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PGGT1B-204ENST00000503638 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1B-204ENST00000503638 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PGGT1B-204ENST00000503638 GPSM2P81274 684 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1B-204ENST00000503638 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.66■□□□□ 0.26
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PGGT1B-204ENST00000503638 UFL1O94874 794 aa16.65■□□□□ 0.26
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
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PGGT1B-204ENST00000503638 MTX1Q13505 466 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC24Q50LG9 513 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
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PGGT1B-204ENST00000503638 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.61■□□□□ 0.25
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PGGT1B-204ENST00000503638 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 EYA3Q99504 573 aa16.61■□□□□ 0.25
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PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.6■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 NEFLP07196 543 aa16.6■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 IARSP41252 1262 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1B-204ENST00000503638 WASHC4Q2M389 1173 aa16.6■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PGGT1B-204ENST00000503638 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.6■□□□□ 0.25
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