RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 PDE8AO60658 829 aa29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 RPS12P25398 132 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SAPCD2Q86UD0 394 aa29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 HHIPL1Q96JK4 782 aa29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SPEF2Q9C093 1822 aa29.05■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RTL9Q8NET4 1388 aa29.05■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TSPYL6Q8N831 410 aa29.05■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP2K2P36507 400 aa29.04■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 GRM1Q13255 1194 aa29.04■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 DOK7Q18PE1 504 aa29.04■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC27Q2M243 656 aa29.04■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 BEGAINQ9BUH8 593 aa29.04■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.04■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.03■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 GGA1Q9UJY5 639 aa29.03■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 UFL1O94874 794 aa29.02■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 KSR2Q6VAB6 950 aa29.02■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.02■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.02■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF408Q9H9D4 720 aa29.01■■■□□ 2.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF609O15014 1411 aa29.01■■■□□ 2.23
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TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 STK31Q9BXU1 1019 aa29.01■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC184Q52MB2 194 aa29■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 USP48Q86UV5 1035 aa29■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 XDHP47989 1333 aa28.99■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 G3V3G9 751 aa28.99■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 AOC2O75106 756 aa28.99■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 IGKV5-2P06315 115 aa28.99■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.99■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 WWC1Q8IX03 1113 aa28.99■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 EGFRP00533 1210 aa28.98■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CTSWP56202 376 aa28.98■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.98■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 IL16Q14005 1332 aa28.97■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.97■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CA12O43570 354 aa28.95■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.95■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.95■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP2B4P23634 1241 aa28.94■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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TRDMT1-211ENST00000495022 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.94■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.93■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 HUNKP57058 714 aa28.92■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC4A2P04920 1241 aa28.91■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 NOGQ13253 232 aa28.91■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 DLK2Q6UY11 383 aa28.9■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 G2E3Q7L622 706 aa28.9■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 PODNQ7Z5L7 613 aa28.9■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 GREM2Q9H772 168 aa28.9■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 MED23Q9ULK4 1368 aa28.9■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.9■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ADM5C9JUS6 153 aa28.89■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 GGA3Q9NZ52 723 aa28.89■■■□□ 2.22
TRDMT1-211ENST00000495022 H7C1W4 665 aa28.88■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 SULF1Q8IWU6 871 aa28.88■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.88■■■□□ 2.21
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TRDMT1-211ENST00000495022 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.88■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.88■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 ABHD8Q96I13 439 aa28.88■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 USP17L3A6NCW0 530 aa28.87■■■□□ 2.21
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TRDMT1-211ENST00000495022 FLIIQ13045 1269 aa28.87■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.87■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.87■■■□□ 2.21
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TRDMT1-211ENST00000495022 RGMBQ6NW40 437 aa28.86■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 MRS2Q9HD23 443 aa28.86■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.86■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 USP17L8P0C7I0 530 aa28.85■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 GCKRQ14397 625 aa28.85■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 SCARF1Q14162 830 aa28.84■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.84■■■□□ 2.21
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