RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GSTT1P30711 240 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 ST13P50502 369 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 HYAL2Q12891 473 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 GRM2Q14416 872 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 TGIF2Q9GZN2 237 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 ZFATQ9P243 1243 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 KANSL3Q9P2N6 904 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 NAALADL2Q58DX5 795 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 NCAPG2Q86XI2 1143 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 BHMTQ93088 406 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PP55 124 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 CD33P20138 364 aa12.14□□□□□ -0.47
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PTPRC-212ENST00000491302 HS2ST1Q7LGA3 356 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 KIF4AO95239 1232 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa12.13□□□□□ -0.47
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A3Q99726 388 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 CCSER2Q9H7U1 834 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 POTECB2RU33 542 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 NRLP54845 237 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 GRIN2CQ14957 1233 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 PCSK7Q16549 785 aa12.11□□□□□ -0.47
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PTPRC-212ENST00000491302 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZNB5 142 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 LIN7BQ9HAP6 207 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 LATS2Q9NRM7 1088 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 HCN2Q9UL51 889 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 PRR12Q9ULL5 1215 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 PPFIA3O75145 1194 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 MEI1Q5TIA1 1274 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 SV2AQ7L0J3 742 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 DRC1Q96MC2 740 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 GGT7Q9UJ14 662 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-212ENST00000491302 CDC14CA4D256 554 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF654Q8IZM8 581 aa12.08□□□□□ -0.48
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PTPRC-212ENST00000491302 OSMRQ99650 979 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 PPM1HQ9ULR3 514 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 GPLD1P80108 840 aa12.07□□□□□ -0.48
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PTPRC-212ENST00000491302 USP48Q86UV5 1035 aa12.07□□□□□ -0.48
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PTPRC-212ENST00000491302 TRPM4Q8TD43 1214 aa12.07□□□□□ -0.48
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PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 FCGRTP55899 365 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 DTHD1Q6ZMT9 781 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 CCNJLQ8IV13 435 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 VWA5B2Q8N398 1253 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 RBSNQ9H1K0 784 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 SIK1P57059 783 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 CTBSQ01459 385 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf58Q8NDZ4 430 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 DZANK1Q9NVP4 752 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 SLC43A3Q8NBI5 491 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 TCF12Q99081 682 aa12.04□□□□□ -0.48
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PTPRC-212ENST00000491302 SIN3BO75182 1162 aa12.03□□□□□ -0.48
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PTPRC-212ENST00000491302 PWP1Q13610 501 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN10Q9HC96 672 aa12.03□□□□□ -0.48
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PTPRC-212ENST00000491302 GHRHP01286 108 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-212ENST00000491302 RLBP1P12271 317 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-212ENST00000491302 SYT9Q86SS6 491 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-212ENST00000491302 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-212ENST00000491302 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-212ENST00000491302 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-212ENST00000491302 ACBD3Q9H3P7 528 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-212ENST00000491302 IGFLR1Q9H665 355 aa12.02□□□□□ -0.49
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