RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 RTL9Q8NET4 1388 aa23.97■■□□□ 1.43
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PTPRN-217ENST00000489650 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-217ENST00000489650 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-217ENST00000489650 EYA3Q99504 573 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-217ENST00000489650 MYD88Q99836 296 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-217ENST00000489650 ADM5C9JUS6 153 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 GOLGA2Q08379 1002 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
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PTPRN-217ENST00000489650 CA12O43570 354 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
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PTPRN-217ENST00000489650 ZNF853P0CG23 659 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 NOGQ13253 232 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 APAF1O14727 1248 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 UFL1O94874 794 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 RGMBQ6NW40 437 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRN-217ENST00000489650 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.91■■□□□ 1.42
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PTPRN-217ENST00000489650 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.9■■□□□ 1.42
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PTPRN-217ENST00000489650 DGKZQ13574 1117 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 GGA1Q9UJY5 639 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 GNAI1P63096 354 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 IFT57Q9NWB7 429 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 PDE8AO60658 829 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 GGA3Q9NZ52 723 aa23.87■■□□□ 1.41
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PTPRN-217ENST00000489650 SCARF1Q14162 830 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
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PTPRN-217ENST00000489650 CCDC102AQ96A19 550 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-217ENST00000489650 CDCA5Q96FF9 252 aa23.84■■□□□ 1.41
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PTPRN-217ENST00000489650 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 TRPA1O75762 1119 aa23.81■■□□□ 1.4
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PTPRN-217ENST00000489650 RNF186Q9NXI6 227 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 XDHP47989 1333 aa23.81■■□□□ 1.4
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PTPRN-217ENST00000489650 PSME4Q14997 1843 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 ATP2B4P23634 1241 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 CSRNP1Q96S65 589 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 SPEF2Q9C093 1822 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 SLC10A3P09131 477 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L8P0C7I0 530 aa23.79■■□□□ 1.4
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PTPRN-217ENST00000489650 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L3A6NCW0 530 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L4A6NCW7 530 aa23.78■■□□□ 1.4
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PTPRN-217ENST00000489650 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 MXD3Q9BW11 206 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRN-217ENST00000489650 KSR2Q6VAB6 950 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRN-217ENST00000489650 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 FBXW7Q969H0 707 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF609O15014 1411 aa23.75■■□□□ 1.39
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