RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 ADM5C9JUS6 153 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 CFAP44Q96MT7 982 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 MBIPQ9NS73 344 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 RGS19P49795 217 aa22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 DGKZQ13574 1117 aa22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 RGMBQ6NW40 437 aa22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.02■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.02■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 G3V3G9 751 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 GOLGA2Q08379 1002 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 MYD88Q99836 296 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 UFL1O94874 794 aa22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 PODXL2Q9NZ53 605 aa22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 GGA3Q9NZ52 723 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 GGA1Q9UJY5 639 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF853P0CG23 659 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 SULF1Q8IWU6 871 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC102AQ96A19 550 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.97■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 PDE8AO60658 829 aa21.96■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.96■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 PSME4Q14997 1843 aa21.96■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 TRPA1O75762 1119 aa21.95■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SCARF1Q14162 830 aa21.95■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 CDCA5Q96FF9 252 aa21.95■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 APAF1O14727 1248 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 IFT57Q9NWB7 429 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 RNF186Q9NXI6 227 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SLC10A3P09131 477 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 GNAI1P63096 354 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SLC34A2O95436 690 aa21.92■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 CSRNP1Q96S65 589 aa21.92■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 XDHP47989 1333 aa21.91■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 GMLQ99445 158 aa21.91■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SPEF2Q9C093 1822 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 USP17L8P0C7I0 530 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 ATP2B4P23634 1241 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 MYH3P11055 1940 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 USP17L3A6NCW0 530 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 USP17L4A6NCW7 530 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF609O15014 1411 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.88■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PODNQ7Z5L7 613 aa21.88■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.88■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CTSWP56202 376 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 MOB2Q70IA6 237 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 TSPYL6Q8N831 410 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.86■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 MXD3Q9BW11 206 aa21.86■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 IGKV5-2P06315 115 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 FKBP1BP68106 108 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 KSR2Q6VAB6 950 aa21.85■■□□□ 1.09
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