RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 ADM5C9JUS6 153 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 CFAP44Q96MT7 982 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 MBIPQ9NS73 344 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 RGS19P49795 217 aa22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 DGKZQ13574 1117 aa22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 RGMBQ6NW40 437 aa22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.02■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TOP3B-217ENST00000489581 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.02■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 G3V3G9 751 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 GOLGA2Q08379 1002 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 MYD88Q99836 296 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 UFL1O94874 794 aa22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 PODXL2Q9NZ53 605 aa22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 GGA3Q9NZ52 723 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 GGA1Q9UJY5 639 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF853P0CG23 659 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 SULF1Q8IWU6 871 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC102AQ96A19 550 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.97■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 PDE8AO60658 829 aa21.96■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.96■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 PSME4Q14997 1843 aa21.96■■□□□ 1.11
TOP3B-217ENST00000489581 TRPA1O75762 1119 aa21.95■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SCARF1Q14162 830 aa21.95■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 CDCA5Q96FF9 252 aa21.95■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 APAF1O14727 1248 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 IFT57Q9NWB7 429 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 RNF186Q9NXI6 227 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SLC10A3P09131 477 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 GNAI1P63096 354 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SLC34A2O95436 690 aa21.92■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 CSRNP1Q96S65 589 aa21.92■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 XDHP47989 1333 aa21.91■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 GMLQ99445 158 aa21.91■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 SPEF2Q9C093 1822 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 USP17L8P0C7I0 530 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 ATP2B4P23634 1241 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 MYH3P11055 1940 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-217ENST00000489581 USP17L3A6NCW0 530 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 USP17L4A6NCW7 530 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF609O15014 1411 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.88■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PODNQ7Z5L7 613 aa21.88■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.88■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CTSWP56202 376 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 MOB2Q70IA6 237 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 TSPYL6Q8N831 410 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.86■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 MXD3Q9BW11 206 aa21.86■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 IGKV5-2P06315 115 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 FKBP1BP68106 108 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 KSR2Q6VAB6 950 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms