RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488787.5

GTPBP1-212, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
GTPBP1-212ENST00000488787 LRRC37AA6NMS7 1700 aa29.06■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.06■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 OLFM4Q6UX06 510 aa29.06■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.06■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC51AQ86UW1 340 aa29.06■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 SIL1Q9H173 461 aa29.06■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 CHRNDQ07001 517 aa29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC93Q567U6 631 aa29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.03■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 SNED1Q8TER0 1413 aa29.03■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 GPSM2P81274 684 aa29.02■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 MPNDQ8N594 471 aa29.02■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.02■■■□□ 2.24
GTPBP1-212ENST00000488787 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.01■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 DCTPP1Q9H773 170 aa29.01■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 XDHP47989 1333 aa29■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 GPR162Q16538 588 aa29■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 METTL24Q5JXM2 366 aa29■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.99■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.99■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.99■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.99■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.98■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 RAB11FIP3O75154 756 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 TAF5LO75529 589 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 SASH1O94885 1247 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 ATP2B4P23634 1241 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 PSMD1Q99460 953 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 LTBP1Q14766 1721 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 A0A1B0GUL6 1792 aa28.96■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 GRIN3BO60391 1043 aa28.96■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 PDE8BO95263 885 aa28.96■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 IGHDP01880 384 aa28.96■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 GGA1Q9UJY5 639 aa28.96■■■□□ 2.23
GTPBP1-212ENST00000488787 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 TFCP2Q12800 502 aa28.95■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.95■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.95■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 POLLQ9UGP5 575 aa28.95■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.94■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 NFKBIEO00221 500 aa28.94■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.94■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 UFL1O94874 794 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 UBE4AQ14139 1066 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 GCC1Q96CN9 775 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.92■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.92■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.92■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 C6orf229H3BNL8 230 aa28.91■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 FGFR2P21802 821 aa28.91■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.91■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 GPR108Q9NPR9 543 aa28.91■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.91■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 SNAP23O00161 211 aa28.9■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 KCNJ4P48050 445 aa28.9■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 SMC5Q8IY18 1101 aa28.9■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 VPS33BQ9H267 617 aa28.9■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 EYA3Q99504 573 aa28.89■■■□□ 2.22
GTPBP1-212ENST00000488787 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.88■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 LPIN2Q92539 896 aa28.88■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 APBB1O00213 710 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 RASSF7Q02833 373 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 ATP2B3Q16720 1220 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 WASHC4Q2M389 1173 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC5A1P13866 664 aa28.86■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.85■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 TNNI3KQ59H18 835 aa28.85■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.85■■■□□ 2.21
GTPBP1-212ENST00000488787 MED23Q9ULK4 1368 aa28.85■■■□□ 2.21
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