RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 LTBP1Q14766 1721 aa36.91■■■■□ 3.5
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HOXB3-208ENST00000476342 PODXL2Q9NZ53 605 aa36.91■■■■□ 3.5
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HOXB3-208ENST00000476342 C1orf115Q9H7X2 142 aa36.86■■■■□ 3.49
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HOXB3-208ENST00000476342 KLRK1P26718 216 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-208ENST00000476342 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-208ENST00000476342 AAMPQ13685 434 aa36.6■■■■□ 3.45
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HOXB3-208ENST00000476342 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF541Q9H0D2 1346 aa36.6■■■■□ 3.45
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