RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472461.1

SZRD1-205, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SZRD1, Length 843 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-205ENST00000472461 OLFM4Q6UX06 510 aa23.08■■□□□ 1.29
SZRD1-205ENST00000472461 CACNA1SQ13698 1873 aa23.08■■□□□ 1.29
SZRD1-205ENST00000472461 CIAO1O76071 339 aa23.07■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 GPR162Q16538 588 aa23.07■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.07■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 CHRNDQ07001 517 aa23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 CCDC93Q567U6 631 aa23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 SLC51AQ86UW1 340 aa23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 SPEF2Q9C093 1822 aa23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 METTL24Q5JXM2 366 aa23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.286e-10■■■■■ 31.5
SZRD1-205ENST00000472461 GPSM2P81274 684 aa23.04■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.04■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 MPNDQ8N594 471 aa23.04■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.04■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.03■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 XDHP47989 1333 aa23.03■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 TAF5LO75529 589 aa23.02■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.02■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.02■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.02■■□□□ 1.28
SZRD1-205ENST00000472461 DCTPP1Q9H773 170 aa23.01■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 GGA1Q9UJY5 639 aa23.01■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 PDE8BO95263 885 aa23■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 ATP2B4P23634 1241 aa23■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 KCNJ4P48050 445 aa23■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 ERC1Q8IUD2 1116 aa23■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 C6orf229H3BNL8 230 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 APBB1O00213 710 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 GRIN3BO60391 1043 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 RAB11FIP3O75154 756 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 SASH1O94885 1247 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 IGHDP01880 384 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 TFCP2Q12800 502 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 UFL1O94874 794 aa22.98■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.98■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.98■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.98■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 PSMD1Q99460 953 aa22.98■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 POLLQ9UGP5 575 aa22.98■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 GCC1Q96CN9 775 aa22.97■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.97■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.97■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.97■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 SNAP23O00161 211 aa22.96■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.96■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.96■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 SNED1Q8TER0 1413 aa22.96■■□□□ 1.27
SZRD1-205ENST00000472461 NFKBIEO00221 500 aa22.95■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 UBE4AQ14139 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 EYA3Q99504 573 aa22.95■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.94■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 RASSF7Q02833 373 aa22.94■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 ATP2B3Q16720 1220 aa22.94■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.94■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.94■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 WASHC4Q2M389 1173 aa22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 LPIN2Q92539 896 aa22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 BCL11AQ9H165 835 aa22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 RIMBP2O15034 1052 aa22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 SLC5A1P13866 664 aa22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 FGFR2P21802 821 aa22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 VPS33BQ9H267 617 aa22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 GPR108Q9NPR9 543 aa22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 LTBP1Q14766 1721 aa22.91■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 TIMM10P62072 90 aa22.91■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 TNNI3KQ59H18 835 aa22.91■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 SMC5Q8IY18 1101 aa22.91■■□□□ 1.26
SZRD1-205ENST00000472461 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms