RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 EYA3Q99504 573 aa27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF181Q9P0P0 153 aa27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 GGA1Q9UJY5 639 aa27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 C6orf229H3BNL8 230 aa27.09■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 VPS33BQ9H267 617 aa27.09■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.09■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.09■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.08■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
RALGPS1-212ENST00000472427 UFL1O94874 794 aa27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP2B4P23634 1241 aa27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNJ4P48050 445 aa27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO3Q9UK99 471 aa27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 CHRNDQ07001 517 aa27.06■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC51AQ86UW1 340 aa27.06■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 SBF1O95248 1867 aa27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 PPIP5K2O43314 1243 aa27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 JDP2Q8WYK2 163 aa27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 LTBP1Q14766 1721 aa27.04■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP8B2P98198 1209 aa27.04■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.04■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.04■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 EYA2O00167 538 aa27.03■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 UTRNP46939 3433 aa27.03■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 WASHC4Q2M389 1173 aa27.03■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 METTL24Q5JXM2 366 aa27.03■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.03■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 COPRSQ9NQ92 184 aa27.03■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 HMMRO75330 724 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 CIAO1O76071 339 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP85Q6P2H3 762 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 NIM1KQ8IY84 436 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 SIL1Q9H173 461 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-212ENST00000472427 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 G3V3G9 751 aa27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 AOC3Q16853 763 aa27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 DCAF8Q5TAQ9 597 aa27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 POLLQ9UGP5 575 aa27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC24Q50LG9 513 aa27■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 CRBNQ96SW2 442 aa27■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A1B0GUL6 1792 aa26.99■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 YY1P25490 414 aa26.99■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 SSH3Q8TE77 659 aa26.99■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 MED23Q9ULK4 1368 aa26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 RIMBP2O15034 1052 aa26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 PRELPP51888 382 aa26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 AAMPQ13685 434 aa26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 POLA2Q14181 598 aa26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 TAF5LO75529 589 aa26.97■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.97■■□□□ 1.91
RALGPS1-212ENST00000472427 PDE8BO95263 885 aa26.95■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 UBE4AQ14139 1066 aa26.95■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.94■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.94■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.94■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.93■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 FZD9O00144 591 aa26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 ECE2O60344 883 aa26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC5A1P13866 664 aa26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 DOK7Q18PE1 504 aa26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 COA1Q9GZY4 146 aa26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms