RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	TCIRG1	Q13488	830 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	TRPA1	O75762	1119 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	GRAP	Q13588	217 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	SULF1	Q8IWU6	871 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	WASHC4	Q2M389	1173 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	NLRP10	Q86W26	655 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	TSPYL6	Q8N831	410 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	GCC1	Q96CN9	775 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	EYA3	Q99504	573 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TTLL3-223	ENST00000466245	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245		E9PSI1	815 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	VAMP4	O75379	141 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	NECTIN2	Q92692	538 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF428	Q96B54	188 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	STK31	Q9BXU1	1019 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF186	Q9NXI6	227 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245		G3V3G9	751 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	C6orf229	H3BNL8	230 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	PSMD14	O00487	310 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC10A3	P09131	477 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	ZIC5	Q96T25	663 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	YDJC	A8MPS7	323 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	MIER1	Q8N108	512 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	MYH3	P11055	1940 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	FKBP1B	P68106	108 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SLFN5	Q08AF3	891 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	KSR2	Q6VAB6	950 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC51A	Q86UW1	340 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF1	P21675	1872 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SHTN1	A0MZ66	631 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	ADM5	C9JUS6	153 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	RIMBP2	O15034	1052 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	ECE2	O60344	883 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	GGA3	Q9NZ52	723 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC4A2	P04920	1241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	CDCA5	Q96FF9	252 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	CSRNP1	Q96S65	589 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-223	ENST00000466245	FLII	Q13045	1269 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	NF2	P35240	595 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	DOK7	Q18PE1	504 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	EGFR	P00533	1210 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	SREBF2	Q12772	1141 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	DLK2	Q6UY11	383 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	G2E3	Q7L622	706 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	LINS1	Q8NG48	757 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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