RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	METTL24	Q5JXM2	366 aa		10.37	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		10.37	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	RTL9	Q8NET4	1388 aa		10.37	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	ATP2B4	P23634	1241 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	MTX1	Q13505	466 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	AAMP	Q13685	434 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	GGA1	Q9UJY5	639 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		10.36	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	UFL1	O94874	794 aa		10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	POLA2	Q14181	598 aa		10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	CIAO1	O76071	339 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	RASSF7	Q02833	373 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	TFCP2	Q12800	502 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	EYA3	Q99504	573 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	FBXO3	Q9UK99	471 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		10.34	□□□□□ -0.75
IL6-208	ENST00000464710	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	XDH	P47989	1333 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	SNAP23	O00161	211 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	PPIP5K2	O43314	1243 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	PDE8B	O95263	885 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	SLX4	Q8IY92	1834 aa		10.33	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	NFKBIE	O00221	500 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	RAB11FIP3	O75154	756 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	TIMM10	P62072	90 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	AOC3	Q16853	763 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	JDP2	Q8WYK2	163 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	PSMD1	Q99460	953 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	RNF181	Q9P0P0	153 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	TAF1	P21675	1872 aa		10.32	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	SASH1	O94885	1247 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	IGHD	P01880	384 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	SLC5A1	P13866	664 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	LMNB1	P20700	586 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	UBE4A	Q14139	1066 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	VPS37D	Q86XT2	251 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	DCTPP1	Q9H773	170 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	LAMB2	P55268	1798 aa		10.31	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	NIM1K	Q8IY84	436 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	LPIN2	Q92539	896 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	VPS33B	Q9H267	617 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.3	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	MYH3	P11055	1940 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	GYG1	P46976	350 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76

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